Vinashin cho hay trong 2 năm (2008-2009), Tập đoàn đã triển khai một số dự án đóng tàu thông qua 4 đơn vị thành viên. Các dự án này gồm tàu 53.000 tấn tại Công ty TNHH một thành viên đóng tàu Hạ Long; Dự án đóng tàu 34.000 tấn tại Công ty đóng tàu Phà Rừng. Hai dự án khác gồm tàu chở ôtô 6.900 tấn, tàu chở hàng 56.200 tấn thuộc Công ty Nam Triệu và dự án đóng tàu 4.600 tấn tại Công ty Bến Kiền.

Để thực hiện các dự án trên Vinashin đã chỉ định cho công ty con của tập đoàn được nhập ủy thác một số thiết bị vật tư với tổng số thuế quyết toán là 40 tỷ đồng. Tuy nhiên khủng hoảng kinh tế thế giới kéo dài đã ảnh hưởng nghiêm trọng đến ngành đóng tàu. Do vậy, trong 5 dự án kể trên chỉ có dự án đóng tàu 34.000 tấn hoàn thành, đã xuất khẩu và đang làm thủ tục quyết toán.

Các dự án còn lại hầu hết đều dang dở hoặc phải chuyến bán cho chủ tàu trong nước.

Vinashin đang giai đoạn tái cơ cấu các đơn vị thành viên. Và trong kế hoạch này, tập đoàn thực hiện việc giải thể doanh nghiệp thành viên là Công ty Xuất nhập khẩu Vinashin. Công ty này tuyên bố phá sản và để lại khoản thuế treo 40 tỷ đồng.

Vì thế, tập đoàn này đề xuất Bộ Tài chính cho phép chuyển giao nghĩa vụ theo dõi, quyết toán và làm thủ tục thanh khoản các tờ khai hải quan cho những đơn vị đang triển khai dự án tàu còn dang dở.